内蒙古医科大学附属医院科研部在医院党委、行政的正确领导下，对接国家及自治区战略需求，制订科技发展规划，着力提升医院的科研竞争力。主要承担医院科学研究、科研平台建设及学术交流等工作。

　　医院现有自治区医疗卫生领先重点学科实验室27个：其中领先学科8个，重点学科18个，重点实验室1个。先后有5个学科入选国家临床医学研究中心分中心，1个学科入选核心成员单位。2018年神经系统疾病与妇产疾病获批自治区临床医学研究中心。医院共设有各级各类科研平台20个，其中省部级科研平台12个，校级重点科研平台8个。2019年医院开始样本库的筹建工作，整体占地面积约500m2，总存储量可达132.87万。

　　承担科研项目共计3413项，经费达16908.18万元，其中国家级项目133项，省部级项目900余项。发表SCI论文900余篇。获科研成果奖励442项，其中获国家卫生部乙级奖1项；自治区级科研成果奖205项，其中一等奖4项；厅局级科研成果奖236项。获批卫健委推广项目24项。获批专利210项，其中发明专利6项，实用新型专利204项。

　　医院高度重视科研人才的引进与培养，截止目前获批自治区教育厅科技创新团队2项，经费100万元；校级科研团队21项，资助经费共101万元；教育厅青年科技英才40项，经费1060万元。

　　积极推进科研成果的推广与转化工作。医院研发的“加味蜂房丸”已通过内蒙古中蒙医药研究院转化平台从内蒙古医科大学附属医院调剂至海南博鳌超级中医院使用，在海南省地区及我院同时进行“加味蜂房丸”的真实世界研究阶段。