血液内科创建于1972年，是自治区最早建立的血液病专科，拥有一流的求学上进的医疗团队，先进的诊疗环境与诊疗设备，经常与国内多家血液中心交流协作，参加国家新药临床试验40余项，医教研紧跟学术前沿。2002年就被评为内蒙古卫生系统重点学科，自治区血液病质控中心挂靠我院。

　　共有医护人员69名（医师25名、护士40名、检验技师4人），其中主任医师（教授）5人，副主任医师3人，拥有博士学位5人，在读博士学位1位，硕士学位17人，硕士生导师4人。在中华医学会、中国免疫学会、中国医师协会等任全国委员；内蒙古医学会、医师协会主委、副主委；内蒙古抗癌协会、免疫学会血液专业主任委员等。

　　开放床位105张，其中百级层流移植病房4间。配套有先进的血细胞分离机、-80℃深低温冰箱、超净工作台等设备。血液科实验室开展骨髓细胞形态学检测、细胞化学染色等。医院检验平台有免疫分型、分子生物学等检测项目。保障血液病的规范化诊断监测，并为治疗提供支持帮助。

　　年门诊量25000以上，住院患者2500以上，收治患者以各种贫血出血及血液肿瘤如白血病、骨髓增生异常综合征、淋巴瘤和骨髓瘤等为主。传统治疗外，各类新型靶向药物及免疫治疗等在我科常规应用。2020年重新启动自体造血干细胞移植项目，独立完成自体造血干细胞动员、采集、冻存、回输等全流程工作。参照国内多家移植中心方案优点，目前我科所采用动员、预处理方案具有安全、高效、费用低廉的优势。2021年5月成功开展自治区首例全相合异基因造血干细胞移植。截至2023年5月，已完成25例自体造血干细胞移植， 3例异基因造血干细胞移植。